Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 1700041I07Rik-201ENSMUST00000197536 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm8479-202ENSMUST00000204366 1070 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm1943-201ENSMUST00000211890 174 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC158802.1-201ENSMUST00000219693 361 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fam209-201ENSMUST00000029007 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ccl17-201ENSMUST00000034232 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fxyd2-201ENSMUST00000041005 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cd300ld-201ENSMUST00000045075 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Dtna-201ENSMUST00000047954 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Atp5k-201ENSMUST00000049628 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr444-201ENSMUST00000095955 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Zfp819-201ENSMUST00000032661 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Prg4-202ENSMUST00000111901 3495 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Clca2-201ENSMUST00000040465 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fn3k-203ENSMUST00000103014 3841 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rcbtb2-218ENSMUST00000169479 3351 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cth-201ENSMUST00000118539 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm9430-201ENSMUST00000121232 1527 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Abhd12b-206ENSMUST00000182927 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cdh26-201ENSMUST00000042092 2891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pld1-203ENSMUST00000123539 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6348-201ENSMUST00000200751 1443 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6468-201ENSMUST00000201076 1443 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6346-201ENSMUST00000201146 1443 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Trmt2b-202ENSMUST00000087541 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gsk3b-202ENSMUST00000114750 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Stmn1-202ENSMUST00000105867 802 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Obp2b-201ENSMUST00000114192 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rhox4f-201ENSMUST00000115170 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm11461-201ENSMUST00000119909 387 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm14855-201ENSMUST00000119925 192 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 4930417H01Rik-201ENSMUST00000123403 1233 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm15627-201ENSMUST00000140421 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 H2-M10.4-202ENSMUST00000169950 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 2410137M14Rik-202ENSMUST00000173707 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm27927-201ENSMUST00000183791 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm7863-201ENSMUST00000184700 805 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm28477-201ENSMUST00000188125 406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm32460-201ENSMUST00000195647 232 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm35177-201ENSMUST00000216525 623 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms