Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Anapc15-205ENSMUST00000106978 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm11514-201ENSMUST00000117670 432 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm14260-201ENSMUST00000125121 260 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm13402-201ENSMUST00000153600 424 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Kank3-204ENSMUST00000173789 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Sdhd-201ENSMUST00000000175 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Atpaf1-202ENSMUST00000175725 996 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mrgprc7-ps-201ENSMUST00000187169 952 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Il24-202ENSMUST00000187650 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm28233-201ENSMUST00000189360 356 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Sh2d1a-207ENSMUST00000189753 1223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 4930432M17Rik-202ENSMUST00000196899 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Iglc4-201ENSMUST00000197046 314 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm44033-201ENSMUST00000203699 695 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm9967-202ENSMUST00000205660 361 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm45014-201ENSMUST00000207657 405 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AC158802.1-201ENSMUST00000219693 361 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm11567-201ENSMUST00000078442 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm24145-201ENSMUST00000082631 163 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gpr1-201ENSMUST00000050536 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Ccdc173-201ENSMUST00000094942 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Cct7-203ENSMUST00000204592 1544 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Zbbx-202ENSMUST00000107775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb1P13372 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Snora17-201ENSMUST00000104004 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Arpc3-204ENSMUST00000111716 838 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm12046-201ENSMUST00000118536 331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm9050-201ENSMUST00000119501 448 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm13673-201ENSMUST00000122056 531 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 H2-M10.4-202ENSMUST00000169950 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Pabpn1-208ENSMUST00000172557 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm26963-201ENSMUST00000183172 941 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37619-201ENSMUST00000193219 724 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms