Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Fgr-201ENSMUST00000030693 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Atxn1-202ENSMUST00000167708 3751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Dync2h1-202ENSMUST00000139115 2892 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Rnf6-208ENSMUST00000169407 3276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Zfp248-201ENSMUST00000069292 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Cyp2c37-201ENSMUST00000049178 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Pygb-201ENSMUST00000045441 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Mark3-206ENSMUST00000221459 2807 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Rab27a-203ENSMUST00000184146 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Rpl37rt-202ENSMUST00000124641 294 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm9142-201ENSMUST00000187161 955 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm7839-201ENSMUST00000210755 673 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Immt-201ENSMUST00000064062 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm45821-201ENSMUST00000211967 1757 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Grip1-207ENSMUST00000130387 2780 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 4930571K23Rik-201ENSMUST00000166958 2153 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Ints10-202ENSMUST00000070713 4192 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Fignl1-206ENSMUST00000171080 2844 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Mill1-201ENSMUST00000066780 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Dsg3-201ENSMUST00000070892 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm13108-201ENSMUST00000122287 1455 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Prickle2-202ENSMUST00000113445 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Tbc1d14-221ENSMUST00000171385 3884 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm12949-201ENSMUST00000143382 362 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RtcbQ99LF4 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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