Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 AC159899.1-201ENSMUST00000214024 733 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm29154-249ENSMUST00000217020 847 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 CT009494.1-201ENSMUST00000225121 1213 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Nr6a1-201ENSMUST00000076275 5941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Tmem41b-203ENSMUST00000119929 2346 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 A530040E14Rik-201ENSMUST00000093501 1515 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm11605-201ENSMUST00000120413 646 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm14334-201ENSMUST00000122030 693 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm17304-201ENSMUST00000167618 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm8521-201ENSMUST00000190394 606 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 CT485606.2-201ENSMUST00000216728 401 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm33929-201ENSMUST00000221762 367 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 AC160991.2-201ENSMUST00000223784 1135 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm7942-201ENSMUST00000163216 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm43154-206ENSMUST00000209562 1884 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gpx5-201ENSMUST00000110491 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Skap2Q3UND0 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms