Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Rbm26-204ENSMUST00000163545 3270 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm37978-201ENSMUST00000194736 2915 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Gfi1P70338 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Gfi1P70338 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Gfi1P70338 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gfi1P70338 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms