Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Rbx1-201ENSMUST00000023036 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Them7-201ENSMUST00000068813 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 AC160340.1-201ENSMUST00000222952 3964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ift46-202ENSMUST00000118186 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms