Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 1810014B01Rik-205ENSMUST00000218691 323 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Pax3-202ENSMUST00000087086 3863 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Atxn1-202ENSMUST00000167708 3751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Srbd1-201ENSMUST00000095187 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Anpep-202ENSMUST00000107392 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm42519-201ENSMUST00000199282 3656 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm10556-201ENSMUST00000180904 3906 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Drp2-204ENSMUST00000113228 3141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm3822-201ENSMUST00000201941 2935 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Pwwp2a-203ENSMUST00000109280 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm44802-201ENSMUST00000208026 1916 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm37649-201ENSMUST00000192079 2232 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC160340.1-201ENSMUST00000222952 3964 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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