Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Vps8-204ENSMUST00000117598 4935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Grhl3-201ENSMUST00000105855 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Phc1-202ENSMUST00000081849 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Itgbl1-201ENSMUST00000049681 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Cast-201ENSMUST00000065629 2910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Jam2-202ENSMUST00000114195 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf17Q99MV7 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf17Q99MV7 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf17Q99MV7 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Olfr449-201ENSMUST00000050729 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf17Q99MV7 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Lrrc66-201ENSMUST00000087177 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf17Q99MV7 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf17Q99MV7 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf17Q99MV7 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gprc5c-202ENSMUST00000053361 3667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 BC026762-201ENSMUST00000206555 2503 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 B130021K23Rik-201ENSMUST00000205226 2593 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Serpina3f-201ENSMUST00000101080 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Elovl4-201ENSMUST00000034796 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Cdhr2-201ENSMUST00000037145 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf17Q99MV7 Uhrf1-203ENSMUST00000113038 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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