Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13713-201ENSMUST00000139377 703 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13713-202ENSMUST00000155472 285 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24298-201ENSMUST00000158299 60 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 1700019N19Rik-202ENSMUST00000166692 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22649-201ENSMUST00000175134 298 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40438-201ENSMUST00000221650 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11567-201ENSMUST00000078442 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Rufy3-202ENSMUST00000196686 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17382-201ENSMUST00000108741 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Prkar1a-202ENSMUST00000106676 962 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16077-201ENSMUST00000121915 655 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14210-201ENSMUST00000140949 503 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12257-201ENSMUST00000148244 585 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2694-209ENSMUST00000210935 1125 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 9230112J17Rik-202ENSMUST00000217430 764 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC154548.2-201ENSMUST00000224621 469 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Copg1-201ENSMUST00000049966 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtpbp6Q3U6U5 2810455O05Rik-201ENSMUST00000138442 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtpbp6Q3U6U5 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtpbp6Q3U6U5 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms