Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5114W4VSN8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm5114W4VSN8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms