Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V9GYH0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V9GYH0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
V9GYH0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
V9GYH0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V9GYH0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
V9GYH0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
V9GYH0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
V9GYH0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms