Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccne2Q9Z238 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccne2Q9Z238 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccne2Q9Z238 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms