Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sfrp4Q9Z1N6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms