Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z117

Zfp53, KRAB-containing zinc-finger protein KRAZ1, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp53Q9Z117 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp53Q9Z117 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp53Q9Z117 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp53Q9Z117 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp53Q9Z117 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp53Q9Z117 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp53Q9Z117 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfp53Q9Z117 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp53Q9Z117 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms