Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn1Q9Z0I7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn1Q9Z0I7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms