Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnip1Q9WUU8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnip1Q9WUU8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnip1Q9WUU8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms