Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms