Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trex2Q9R1A9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms