Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fhl3Q9R059 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fhl3Q9R059 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms