Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Phtf1Q9QZ09 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Phtf1Q9QZ09 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Phtf1Q9QZ09 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Phtf1Q9QZ09 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Phtf1Q9QZ09 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phtf1Q9QZ09 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phtf1Q9QZ09 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms