Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cpsf3Q9QXK7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf3Q9QXK7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms