Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trp53inp1Q9QXE4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms