Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc5Q9QX29 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc5Q9QX29 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms