Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clca3a1Q9QX15 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clca3a1Q9QX15 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms