Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CubnQ9JLB4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms