Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scamp4Q9JKV5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms