Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Habp4Q9JKS5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Habp4Q9JKS5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms