Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms