Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrac1Q9JKP8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms