Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nectin1Q9JKF6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nectin1Q9JKF6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms