Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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