Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl11Q9JHH5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms