Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn12Q9ET43 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms