Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf13bQ9ET35 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13bQ9ET35 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13bQ9ET35 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13bQ9ET35 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13bQ9ET35 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13bQ9ET35 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfrsf13bQ9ET35 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tnfrsf13bQ9ET35 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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