Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hipk3Q9ERH7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms