Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r53Q9EP93 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r53Q9EP93 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms