Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnft1Q9DCN7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms