Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Smg9Q9DB90 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smg9Q9DB90 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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