Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifrd2Q9D8U0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifrd2Q9D8U0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms