Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6Q9D8P7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf3c6Q9D8P7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms