Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snx20Q9D2Y5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms