Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Susd3Q9D176 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Susd3Q9D176 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms