Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gins3Q9CY94 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms