Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
3100002H09RikQ9CXW6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
3100002H09RikQ9CXW6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms