Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx10Q9CWT3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx10Q9CWT3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms