Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Sycp2Q9CUU3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Sycp2Q9CUU3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sycp2Q9CUU3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms