Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg12Q9CQY1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg12Q9CQY1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms