Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PompQ9CQT5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PompQ9CQT5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms