Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StambpQ9CQ26 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
StambpQ9CQ26 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
StambpQ9CQ26 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
StambpQ9CQ26 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
StambpQ9CQ26 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
StambpQ9CQ26 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms