Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sike1Q9CPR7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sike1Q9CPR7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms